他于１９４８年开始与Ｄ．Ｇ．Ｃｈａｍｐｅｒｎｏｗｎｅ一起工作，他是一名大学本科熟人，为尚未存在的机器设计电脑象棋程序 。他将在测试这些程序时扮演机器的“角色” 。因为图灵的同性恋倾向而遭到的迫害使得他的职业生涯尽毁 。１９５２年，他的同性伴侣协同一名同谋一起闯进图灵的房子盗窃，图灵为此而报警，却又因此而扯出自己的“同志”身份 。英国警方的调查结果使得他被控以“明显的猥亵和性颠倒行为”罪 。
他没有申辩，并被定罪 。在著名的公审后，他被给予了两个选择：坐牢和女性荷尔蒙（雌激素）注射“疗法”（当时政府力推、以化学手段解决问题的所谓“化学阉割”） 。
为了能够继续进行科学研究，同时也能顾及面子，他最后选择了雌激素注射，并持续一年 。在这段时间里，药物产生了包括乳房不断发育的副作用，也使原本热爱体育运动的图灵在身心上受到极大伤害 。在当时的英国，同性恋不仅是一种有伤风俗、不可容忍的法定罪行，而且在充斥着怀疑猜忌、间谍危机和勒索敲诈的“冷战”背景下，还会被当成是一种对国家安全的威胁，进而失去清白的“安全记录” 。
有人特别向法庭提及并作证，图灵曾获得过大英帝国勋章，是国宝级的科学家，是“当世最精深最纯粹的数学家之一”，但都无济于事，甚至，反倒还使“丑闻”升级——当地一家报纸在位置报道此事时，用了这样一个标题：《大学教授被处缓刑必须接受化学阉割》 。
１９５４年６月７日，阿兰·麦席森·图灵因食用浸染过氰化物溶液的苹果死亡 。２０１２年１２月，威廉·霍金（Ｗｉｌｌｉａｍ　Ｈａｗｋｉｎｇ）、保罗·纳斯（Ｐａｕｌ　Ｎｕｒｓｅ）、马丁·里斯（Ｍａｒｔｉｎ　Ｒｅｅｓ）等１１人致函英国首相卡梅伦，要求正式为图灵平反 。据外媒报道，英国司法部长克里斯２０１３年１２月２４日宣布，英国女王伊莉莎白二世赦免上世纪５０年代因同性恋行为被定罪的英国著名数学家、密码学家、计算机科学之父阿兰·图灵 。
１９３６年，图灵向伦敦权威的数学杂志投了一篇论文，题为＂论数字计算在决断难题中的应用” 。在这篇开创性的论文中，图灵给“可计算性”下了一个严格的数学定义，并提出著名的“图灵机”的设想 。“图灵机”与“冯·诺伊曼机”齐名，被永远载入计算机的发展史中 。１９５２年的论文今天被视为生物数学的奠基之作，这可以算他短暂科学生涯中第三大杰出贡献：
首先他是第一个提出利用某种机器实现逻辑代码的执行，以模拟人类的各种计算和逻辑思维过程的科学家 。而这一点，成为了后人设计实用计算机的思路来源，成为了当今各种计算机设备的理论基石 。今天世界计算机科学领域的最高荣誉就被称为“图灵奖”，相当于计算机科学界的诺贝尔奖；
其次是他领导了英国政府破译二战德军Ｕ－潜艇密码的工作，为扭转二战盟军的大西洋战场战局立下汗马功劳 。图灵在数学，逻辑学，神经网络和人工智能等领域也作出了很多贡献 。在新旧世纪交替的２０００年，美国《时代》杂志评选的二十世纪对人类发展最有影响的一百名人物中，图灵和沃森·克里克都在仅有二十名的“科学家，思想家”栏中榜上有名 。
图灵是一位科学史上罕见的具有非凡洞察力的奇才：他的独创性成果使他生前就已名扬四海，而他深刻的预见使他死后倍受敬佩 。当人们发现后人的一些独立研究成果似乎不过是在证明图灵思想超越时代的程度时，都为他的英年早逝感到由衷的惋惜 。苹果公司的标志一度被误认为源于图灵自杀时咬下的半个苹果 。但该图案的设计师和苹果公司都否认了这一说法 。

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