新疆虎从被发现之日起就是一个濒危珍稀物种 。老虎作为一种大型食肉动物必须捕食猪、牛、鹿等大型动物才能维持生存，而像兔子、土拨鼠之类的小动物根本就填不饱老虎的胃口 。因此老虎必须生活在水草丰美、树木茂密能孕育大型食草动物的森林，而干旱少雨的草原沙漠地带是不适合老虎生存的 。说到这儿可能大家都会疑惑新疆的自然环境不恰恰正是不适合老虎生存的吗？
其实历史上新疆罗布泊地区也曾分布有大量水草丰美的绿洲 。这也是当地能孕育出古楼兰文明的原因 。可后来随着水土流失、土地沙化使这一地区的环境变得越来越恶劣 。这不仅导致了古楼兰文明的衰落，也使得新疆虎的生存环境受到了严峻的挑战 。1921年夏季塔里木河的改道导致新疆虎的生存环境进一步恶化 。当斯文·赫定在1930年再次前来考察时发现新疆虎的数量已比30年前大为减少 。
1979年2月在印度新德里召开的第一届国际老虎保护会议上国际老虎保护组织正式宣布：全世界共有11个老虎亚种 。目前已有三种灭绝，另有三种濒临灭绝 。在已灭绝的三种老虎中分布在中国新疆塔里木盆地的新疆虎就是其中之一，灭绝的另外两种是朝鲜虎和阿拉伯虎 。除了上文提到的自然环境变化之外人类活动的影响也加速了新疆虎的灭绝 。新疆虎作为一种猛兽不可避免会像其他老虎一样与人类产生冲突 。
在新疆这种依靠河流滋养形成绿洲才适合人畜生存的地方各种动物都挤在为数不多的绿洲里面生活 。这就导致人虎冲突比起其他地方更为剧烈 。人类生产范围持续扩大使新疆虎的生活区域受到严重挤压，加之现代化工具运用到捕猎当中无疑是加剧了新疆虎的灭亡 。在人类活动和自然环境因素的共同作用下塔里木盆地林地、湿地减少 。这导致原先新疆虎生活的区域被分割成大大小小的“孤岛”，
在这些“孤岛”上生活的新疆虎不能与其他地区的老虎取得联系，所以就只能在本区域内交配繁殖 。长期的近亲繁殖现象导致新疆虎这一物种的遗传多样性降低 。这大大增加了新疆虎幼崽出现遗传疾病的可能性 。20世纪60年代以后人们就再难见到新疆虎的踪影 。尽管在此之后民间曾爆出过数次目击事件，但这些目击事件都和前些年目击野生华南虎的事件一样无法得到证实 。
普氏野马的命运比起新疆虎算是不幸中的“幸运儿” 。1878年一个名叫普尔热瓦尔斯基的沙俄军官在中国新疆准格尔盆地发现了一种全新的野马，两年后沙俄学者波利亚科夫将这个新发现的马种命名为普尔热瓦尔斯基野马（简称普氏野马） 。普氏野马也有亚洲野马、蒙古野马、准噶尔野马等多个名称 。普氏野马的故乡是在中国新疆准格尔盆地，但自从这一物种被发现后就引起了俄、法、英等国研究机构和博物馆的极大兴趣 。
1899年至1903年有50匹左右的普氏野马被从中国运抵欧洲 。它们成为了第一批由人工饲养的蒙古野马 。当一匹又一匹野马被从中国掠夺到境外之时野马在故乡的生存状态正在日渐恶化：人类的捕杀和对其栖息地的破坏加速了普氏野马消亡的进程 。在近1个世纪的时间里野马的分布区急剧缩小、数量锐减 。20世纪60年代以后中国境内再未发现过普氏野马的踪迹 。
1986年新疆野马繁育科研中心的成立后开始致力于从欧洲引入当年人工培育的野马 。从那时起我国陆续从欧洲引回野马 。我国在准噶尔盆地南缘、新疆吉木萨尔县建成占地9000亩全亚洲最大的野马饲养繁殖中心 。截至2019年7月中国自从实施普氏野马引入项目以来新疆诞生的普氏野马已到繁衍第6代 。新疆普氏野马存活种群数量已达到416匹：其中野放野马217匹、半散放野马108匹、圈养野马91匹 。

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